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■HDF5ライブラリをUNIXにインストール


Step.1 ダウンロード & インストール

これまでに入れようとして上手くいかなかったのですが，何故かこちらの方法でサクッといけました．
自分でも何故上手くいったのか，良くわかっていない．
バージョンの問題? 環境設定の問題 ?

なお，その前に， こちら を参考に色々いじってたので，この辺の環境設定が効いたのかも．

どうやら，szip や zlib 系のインストールは必要な模様．

$wget http://www.hdfgroup.org/ftp/HDF5/current/src/hdf5-1.8.13.tar.bz2
$sh configure
$make
$make check
$make install

Step.2 環境変数設定

これも良くわかんないけど，最初からパスが通っている．
一応，パスらしきものを通しておく．

setenv PATH "${PATH}:/usr/local/hdf5/bin"
setenv PATH "${PATH}:/usr/local/hdf5/include"

export PATH=$PATH:/usr/local/hdf5/bin"
export PATH=$PATH:/usr/local/hdf5/include"

Step.3 バイナリへの変換

h5dumpコマンドで，中身を見たり，バイナリへの変換が可能．

$h5dump -n GPMCOR_GMI_1403312327_0100_000503_L2S_GL2_02A.h5

こんなのが見える．

HDF5 "GPMCOR_GMI_1403312327_0100_000503_L2S_GL2_02A.h5" {
FILE_CONTENTS {
group /
group /GprofDHeadr
dataset /GprofDHeadr/clusterProfiles
dataset /GprofDHeadr/hgtTopLayer
dataset /GprofDHeadr/speciesDescription
dataset /GprofDHeadr/temperatureDescriptions
group /S1
dataset /S1/Latitude
dataset /S1/Longitude
group /S1/SCstatus
dataset /S1/SCstatus/FractionalGranuleNumber
dataset /S1/SCstatus/SCaltitude
dataset /S1/SCstatus/SClatitude
dataset /S1/SCstatus/SClongitude
dataset /S1/SCstatus/SCorientation
group /S1/ScanTime
dataset /S1/ScanTime/DayOfMonth
dataset /S1/ScanTime/DayOfYear
dataset /S1/ScanTime/Hour
dataset /S1/ScanTime/MilliSecond
dataset /S1/ScanTime/Minute
dataset /S1/ScanTime/Month
dataset /S1/ScanTime/Second
dataset /S1/ScanTime/SecondOfDay
dataset /S1/ScanTime/Year
dataset /S1/cloudWaterPath
dataset /S1/convectPrecipFraction
dataset /S1/databaseExpansionIndex
dataset /S1/iceWaterPath
dataset /S1/liquidPrecipFraction
dataset /S1/mixedWaterPath
dataset /S1/mostLikelyPrecipitation
dataset /S1/numOfSignificantProf
dataset /S1/orographicLiftIndex
dataset /S1/pixelStatus
dataset /S1/precip1stTertial
dataset /S1/precip2ndTertial
dataset /S1/probabilityOfPrecip
dataset /S1/profileNumber
dataset /S1/profileScale
dataset /S1/qualityFlag
dataset /S1/rainWaterPath
dataset /S1/retrievalType
dataset /S1/snowCoverIndex
dataset /S1/spare
dataset /S1/spareIndex
dataset /S1/sunGlintAngle
dataset /S1/surfacePrecipitation
dataset /S1/surfaceSkinTempIndex
dataset /S1/surfaceTypeIndex
dataset /S1/temp2mIndex
dataset /S1/totalColumnWaterVapor
dataset /S1/totalColumnWaterVaporIndex
}
}

あとはこいつでバイナリに変換(1行です)． -o は出力ファイル， -bは入力ファイル, -dはデータのディレクトリを指定する．

$h5dump -d /S1/surfacePrecipitation
-o XPre_GPMCOR_GMI_1403312327_0100_000503_L2S_GL2_02A.bin
-b GPMCOR_GMI_1403312327_0100_000503_L2S_GL2_02A.h5


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